Индекс Жаккара
Индекс Жаккара относится к бинарным коэффициентам сходства и является часто используемым для анализа состава видового состава сообществ или проб в биологических исследованиях. Эта мера сходства является пересечением множеств. Калькулятор разработан в первую очередь для биологов, но является универсальным для оценки пересечения множеств и может быть применен для решения иных, небиологических задач.
Необходимо отметить, что коэффициент Жаккара аналогичен коэффициенту сходства Танимото, но в биологических исследованиях используется именно индекс Жаккара. Когда стоит задача не только сравнения отобранных проб, но и анализ собственных данных по сравнению с данными других исследователей, то имеет смысл использовать коэффициенты, применяемые другими исследователями. Чувствительность коэффициента Жаккара рассмотрена в работе Максимова, Кузнецовой (2013)1, где обосновывается эталонное сходство проб применительно именно к индексу Жаккара.
Расчет индекса Жаккара для серии проб
Первая ячейка данных
Обычно анализируются списки видов в пробах, сообществах, на тестовых площадках и пр., при этом используются бинарные данные, для удобства вычислений наличие вида обозначается 1, а отсутствие 0.
Данный индекс был предложен Полем Жаккаром в 1901 году2.
Коэффициент выражается формулой, обозначающей отношение числа видов, найденных на двух исследуемых участках, к сумме видов, найденных на участке А, но не найденных на участке В, и найденных на участке В, но отсутствующих на участке А. То есть несовпадающие пары, суммированные в знаменателе, имеют вес больший в два раза, по сравнению с совпадающими парами.
где а — количество видов на первой пробной площадке, b — количество видов на второй пробной площадке, с — количество видов, общих для 1-й и 2-й площадок.
При полном несовпадении видов коэффициент равен 0, а при полном совпадении 1.
В этом калькуляторе ввод данных предполагается в виде таблицы (матрицы) данных, причем значения вводятся в бинарном виде 1 или 0.
-
Максимов В.Н., Кузнецова Н.А. Эталон сходства: использование при сравнении состава и структуры сообществ. М.: Товарищество научных изданий КМК. 2013. 89 с. ↩
-
Jaccard P. Distribution de la flore alpine dans le Bassin des Dranses et dans quelques regions voisines // Bull. Soc. Vaudoise sci. Natur. 1901. V. 37. Bd. 140. P. 241-272. ↩
Комментарии